Plugin alterlab-databases
Connectors to scientific databases (PubMed, ChEMBL, UniProt, GEO, and more) (38 skills)
Comment installer le plugin alterlab-databases
Exécutez les deux commandes dans Claude Code. La première ajoute la marketplace une seule fois ; la seconde installe le plugin.
/plugin marketplace add AlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills
/plugin install alterlab-databases@alterlab-academic-skillsContenu de alterlab-databases
38 parties lues depuis les fichiers du plugin.
Skills 38
Claude le charge quand la tâche correspond- alterlab-alphafold-db
Retrieve AI-predicted protein structures by UniProt accession and analyze confidence metrics like pLDDT and PAE.
- alterlab-arxiv
Search and retrieve scientific preprints from arXiv via the Atom API using keywords, authors, IDs, or categories and download their PDFs.
- alterlab-bindingdb
Query measured protein-ligand binding affinities using a REST API or TSV downloads to support drug discovery and SAR analysis.
- alterlab-biorxiv
Search life sciences preprints and retrieve metadata or download full-text PDFs via the bioRxiv API.
- alterlab-brenda
Retrieves enzyme kinetic parameters, reaction equations, and environmental optima from the BRENDA database using web scraping or a SOAP API.
- alterlab-cbioportal
Query the cBioPortal REST API to access cancer genomics data including mutations, copy number alterations, and clinical outcomes across multiple studies.
- alterlab-chembl
Query the ChEMBL database via Python to retrieve bioactive molecules, target information, and bioactivity measurements like IC50 and Ki.
- alterlab-clinicaltrials
Query the ClinicalTrials.gov database to search for clinical studies by condition, drug, location, or status and retrieve detailed trial information.
- alterlab-clinpgx
Access pharmacogenomics data to query gene-drug interactions, CPIC/DPWG dosing guidelines, and clinical pharmacogene records.
- alterlab-clinvar
Query NCBI ClinVar via E-utilities API or FTP to retrieve clinical significance, pathogenicity classifications, and review status for human germline variants.
- alterlab-cosmic
Access somatic mutation data, mutational signatures, and cancer gene census information for cancer research and precision oncology.
- alterlab-datacommons
Aucune description dans le fichier.
- alterlab-depmap
Aucune description dans le fichier.
- alterlab-drugbank
Aucune description dans le fichier.
- alterlab-ena
Aucune description dans le fichier.
- alterlab-ensembl
Aucune description dans le fichier.
- alterlab-fda
Aucune description dans le fichier.
- alterlab-gene-db
Aucune description dans le fichier.
- alterlab-geo
Aucune description dans le fichier.
- alterlab-gnomad
Aucune description dans le fichier.
- alterlab-gtex
Aucune description dans le fichier.
- alterlab-gwas
Aucune description dans le fichier.
- alterlab-hmdb
Aucune description dans le fichier.
- alterlab-imaging-data-commons
Aucune description dans le fichier.
- alterlab-interpro
Aucune description dans le fichier.
- alterlab-jaspar
Aucune description dans le fichier.
- alterlab-kegg
Aucune description dans le fichier.
- alterlab-metabolomics-wb
Aucune description dans le fichier.
- alterlab-monarch
Aucune description dans le fichier.
- alterlab-opentargets
Aucune description dans le fichier.
- alterlab-pdb
Aucune description dans le fichier.
- alterlab-pubchem
Aucune description dans le fichier.
- alterlab-pubmed
Aucune description dans le fichier.
- alterlab-reactome
Aucune description dans le fichier.
- alterlab-string-db
Aucune description dans le fichier.
- alterlab-uniprot
Aucune description dans le fichier.
- alterlab-uspto
Aucune description dans le fichier.
- alterlab-zinc-db
Aucune description dans le fichier.
Utiliser alterlab-databases dans Claude Code
Les Skills ne nécessitent pas de commande. Claude les lit quand votre requête correspond à leur description.
Mettre à jour, désactiver ou supprimer
- Mettre à jour le plugin (shell)
- claude plugin update alterlab-databases@alterlab-academic-skills
- Actualiser le marketplace
- /plugin marketplace update alterlab-academic-skills
- Le désactiver pour le moment
- /plugin disable alterlab-databases@alterlab-academic-skills
- Le supprimer
- /plugin uninstall alterlab-databases@alterlab-academic-skills
Skills dans alterlab-databases
- alterlab-alphafold-dbAlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills
Retrieve AI-predicted protein structures by UniProt accession and analyze confidence metrics like pLDDT and PAE.
5 fichiers86étoiles - alterlab-arxivAlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills
Search and retrieve scientific preprints from arXiv via the Atom API using keywords, authors, IDs, or categories and download their PDFs.
4 fichiers86étoiles - alterlab-bindingdbAlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills
Query measured protein-ligand binding affinities using a REST API or TSV downloads to support drug discovery and SAR analysis.
4 fichiers86étoiles - alterlab-biorxivAlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills
Search life sciences preprints and retrieve metadata or download full-text PDFs via the bioRxiv API.
4 fichiers86étoiles - alterlab-brendaAlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills
Retrieves enzyme kinetic parameters, reaction equations, and environmental optima from the BRENDA database using web scraping or a SOAP API.
12 fichiers86étoiles - alterlab-cbioportalAlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills
Query the cBioPortal REST API to access cancer genomics data including mutations, copy number alterations, and clinical outcomes across multiple studies.
4 fichiers86étoiles - alterlab-chemblAlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills
Query the ChEMBL database via Python to retrieve bioactive molecules, target information, and bioactivity measurements like IC50 and Ki.
4 fichiers86étoiles - alterlab-clinicaltrialsAlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills
Query the ClinicalTrials.gov database to search for clinical studies by condition, drug, location, or status and retrieve detailed trial information.
4 fichiers86étoiles - alterlab-clinpgxAlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills
Access pharmacogenomics data to query gene-drug interactions, CPIC/DPWG dosing guidelines, and clinical pharmacogene records.
7 fichiers86étoiles - alterlab-clinvarAlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills
Query NCBI ClinVar via E-utilities API or FTP to retrieve clinical significance, pathogenicity classifications, and review status for human germline variants.
6 fichiers86étoiles - alterlab-cosmicAlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills
Access somatic mutation data, mutational signatures, and cancer gene census information for cancer research and precision oncology.
5 fichiers86étoiles
Questions sur le plugin alterlab-databases
Comment installer le plugin alterlab-databases ?
Dans Claude Code, exécutez /plugin marketplace add AlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills, puis /plugin install alterlab-databases@alterlab-academic-skills.
Que contient le plugin alterlab-databases ?
alterlab-databases regroupe 38 skills.
Comment mettre à jour ou supprimer le plugin alterlab-databases ?
Mettez-le à jour avec claude plugin update alterlab-databases@alterlab-academic-skills dans votre shell, ou depuis l'onglet Installed de /plugin. Supprimez-le avec /plugin uninstall alterlab-databases@alterlab-academic-skills.