Plugin alterlab-databases
Connectors to scientific databases (PubMed, ChEMBL, UniProt, GEO, and more) (38 skills)
Cómo instalar el plugin alterlab-databases
Ejecuta ambos comandos dentro de Claude Code. El primero agrega el marketplace una vez; el segundo instala el plugin.
/plugin marketplace add AlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills
/plugin install alterlab-databases@alterlab-academic-skillsQué hay dentro de alterlab-databases
38 partes leídas de los archivos del propio plugin.
Skills 38
Claude lo carga cuando la tarea coincide- alterlab-alphafold-db
Retrieve AI-predicted protein structures by UniProt accession and analyze confidence metrics like pLDDT and PAE.
- alterlab-arxiv
Search and retrieve scientific preprints from arXiv via the Atom API using keywords, authors, IDs, or categories and download their PDFs.
- alterlab-bindingdb
Query measured protein-ligand binding affinities using a REST API or TSV downloads to support drug discovery and SAR analysis.
- alterlab-biorxiv
Search life sciences preprints and retrieve metadata or download full-text PDFs via the bioRxiv API.
- alterlab-brenda
Retrieves enzyme kinetic parameters, reaction equations, and environmental optima from the BRENDA database using web scraping or a SOAP API.
- alterlab-cbioportal
Query the cBioPortal REST API to access cancer genomics data including mutations, copy number alterations, and clinical outcomes across multiple studies.
- alterlab-chembl
Query the ChEMBL database via Python to retrieve bioactive molecules, target information, and bioactivity measurements like IC50 and Ki.
- alterlab-clinicaltrials
Query the ClinicalTrials.gov database to search for clinical studies by condition, drug, location, or status and retrieve detailed trial information.
- alterlab-clinpgx
Access pharmacogenomics data to query gene-drug interactions, CPIC/DPWG dosing guidelines, and clinical pharmacogene records.
- alterlab-clinvar
Query NCBI ClinVar via E-utilities API or FTP to retrieve clinical significance, pathogenicity classifications, and review status for human germline variants.
- alterlab-cosmic
Access somatic mutation data, mutational signatures, and cancer gene census information for cancer research and precision oncology.
- alterlab-datacommons
No hay descripción en el archivo.
- alterlab-depmap
No hay descripción en el archivo.
- alterlab-drugbank
No hay descripción en el archivo.
- alterlab-ena
No hay descripción en el archivo.
- alterlab-ensembl
No hay descripción en el archivo.
- alterlab-fda
No hay descripción en el archivo.
- alterlab-gene-db
No hay descripción en el archivo.
- alterlab-geo
No hay descripción en el archivo.
- alterlab-gnomad
No hay descripción en el archivo.
- alterlab-gtex
No hay descripción en el archivo.
- alterlab-gwas
No hay descripción en el archivo.
- alterlab-hmdb
No hay descripción en el archivo.
- alterlab-imaging-data-commons
No hay descripción en el archivo.
- alterlab-interpro
No hay descripción en el archivo.
- alterlab-jaspar
No hay descripción en el archivo.
- alterlab-kegg
No hay descripción en el archivo.
- alterlab-metabolomics-wb
No hay descripción en el archivo.
- alterlab-monarch
No hay descripción en el archivo.
- alterlab-opentargets
No hay descripción en el archivo.
- alterlab-pdb
No hay descripción en el archivo.
- alterlab-pubchem
No hay descripción en el archivo.
- alterlab-pubmed
No hay descripción en el archivo.
- alterlab-reactome
No hay descripción en el archivo.
- alterlab-string-db
No hay descripción en el archivo.
- alterlab-uniprot
No hay descripción en el archivo.
- alterlab-uspto
No hay descripción en el archivo.
- alterlab-zinc-db
No hay descripción en el archivo.
Usando alterlab-databases en Claude Code
Las Skills no necesitan comando. Claude las lee cuando tu solicitud coincide con lo que describen.
Actualizar, desactivar o eliminar
- Actualizar el plugin (shell)
- claude plugin update alterlab-databases@alterlab-academic-skills
- Refrescar el marketplace
- /plugin marketplace update alterlab-academic-skills
- Desactivarlo por ahora
- /plugin disable alterlab-databases@alterlab-academic-skills
- Eliminarlo
- /plugin uninstall alterlab-databases@alterlab-academic-skills
Skills en alterlab-databases
- alterlab-alphafold-dbAlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills
Retrieve AI-predicted protein structures by UniProt accession and analyze confidence metrics like pLDDT and PAE.
5 archivos86estrellas - alterlab-arxivAlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills
Search and retrieve scientific preprints from arXiv via the Atom API using keywords, authors, IDs, or categories and download their PDFs.
4 archivos86estrellas - alterlab-bindingdbAlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills
Query measured protein-ligand binding affinities using a REST API or TSV downloads to support drug discovery and SAR analysis.
4 archivos86estrellas - alterlab-biorxivAlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills
Search life sciences preprints and retrieve metadata or download full-text PDFs via the bioRxiv API.
4 archivos86estrellas - alterlab-brendaAlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills
Retrieves enzyme kinetic parameters, reaction equations, and environmental optima from the BRENDA database using web scraping or a SOAP API.
12 archivos86estrellas - alterlab-cbioportalAlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills
Query the cBioPortal REST API to access cancer genomics data including mutations, copy number alterations, and clinical outcomes across multiple studies.
4 archivos86estrellas - alterlab-chemblAlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills
Query the ChEMBL database via Python to retrieve bioactive molecules, target information, and bioactivity measurements like IC50 and Ki.
4 archivos86estrellas - alterlab-clinicaltrialsAlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills
Query the ClinicalTrials.gov database to search for clinical studies by condition, drug, location, or status and retrieve detailed trial information.
4 archivos86estrellas - alterlab-clinpgxAlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills
Access pharmacogenomics data to query gene-drug interactions, CPIC/DPWG dosing guidelines, and clinical pharmacogene records.
7 archivos86estrellas - alterlab-clinvarAlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills
Query NCBI ClinVar via E-utilities API or FTP to retrieve clinical significance, pathogenicity classifications, and review status for human germline variants.
6 archivos86estrellas - alterlab-cosmicAlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills
Access somatic mutation data, mutational signatures, and cancer gene census information for cancer research and precision oncology.
5 archivos86estrellas
Preguntas sobre el plugin alterlab-databases
¿Cómo instalo el plugin alterlab-databases?
En Claude Code ejecuta /plugin marketplace add AlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills y luego /plugin install alterlab-databases@alterlab-academic-skills.
¿Qué incluye el plugin alterlab-databases?
alterlab-databases agrupa 38 skills.
¿Cómo actualizo o elimino el plugin alterlab-databases?
Actualízalo con claude plugin update alterlab-databases@alterlab-academic-skills en tu shell, o desde la pestaña Installed de /plugin. Elimínalo con /plugin uninstall alterlab-databases@alterlab-academic-skills.